长达五百年的教会与魔女的对立。数年前确立的和平。但在和平的阴影下，世界各地还留着对立的残渣—— 在维尼亚斯王国王立魔法学校读书的差生塞维尔，失去了入学以前的记忆。 受阿尔巴斯校长之命，他离开王国，前往反魔女派势力强大的大陆南部进行特别实习。 与他同行的，是希望阅读魔法原初的禁书《零之书》的魔女萝·库里斯塔丝，秀才少女霍尔德，以及学校唯一的兽化者库德等个性鲜明的人们。 然后，他们在南方遇到的真相是—— 来自《从零开始的魔法书》作者虎走翔的硬核幻想作品！
我什么都想不起来。 自己，到底是什么样的存在—— 魔法学院的学生塞维尔没有一点入学前的记忆。 连自己为什么会在学院里的原因都不知道，就这样过着空虚的学院生活。 连如何努力的方法也不知道，因此成绩一直都是最低的。 而魔法学院的校长・阿尔巴斯，对这样的塞维尔突然提出了危险的“特别实习”。 「在依然进行着魔女狩猎的地域内，希望将魔法的实用性传播开来。」 魔女与教会的战争结束后的数年——世界仍然还没有完全接受魔女和魔法。 时期为“魔法使黎明期”。 这是，一个什么都不是的少年，和隐藏着各自的心伤的同伴们一起，寻找“自我”的故事——