未来世界，人类科技飞速发展，但另一种生物“妖兽”也在人类的空间中横行，它们来去无踪，变化多端，罪恶累累，人类特别成立了特警对来专门对付妖兽，阿龙（黎明）和阿强（张学友）都是这个组织里的一员，他们两人也是出生入死的好兄弟，为警队立下过汗马功劳。不过他们俩的遭遇却大不一样，阿龙深受特警队长器重，而阿强因为母亲是妖兽，而他自己身体也遗传了母亲的基因，所以饱受歧视，经常受到队长的呵斥，无论他怎么做都无法得到信任，阿强虽然感到非常不公平，但一直逆来顺受。特警队计划捉拿妖兽元大宗（仲代达矢），这是一只长期生活在人类社会里的妖兽，已经成为一个某大集团的董事长。其实特警们不知道，元大宗是向往妖兽与人类和平相处的，但他的儿子鬼众道（张耀扬）却是妖兽世界的激进分子，他一直想挑起妖兽与人类的战争，以坐收渔翁之利。而就在此时，阿龙违反特警队的纪律爱上了元大宗的助手——美丽的女妖兽幻姬（李嘉欣），而阿强则涉嫌泄密被勒令停职，特警队内部又出现叛徒，谁来阻止鬼众道的阴谋呢？
