自从地球上诞生了名叫人类的生物，他们就不停地为了将自己的生存条件变得更好而不断进化和进步。但是，人口的爆炸性增长和对资源的过度开采，终于使地球的环境日益恶化，进而慢慢走向荒废。因此，人类开始寻求向外太空移民并定居的可能性，并终于在条件成熟时建起了形如宇宙浮游大陆的卫星城市，而且将各国的主要经济、文化及军事等部门全部转移到卫星上面。这样，每个国家都同时拥有外太空与地面的两块领土，有权有势的达官贵人也就当然地住在太空，而地面上与太空中的住民在政策上受到差别对待的状况，不论当权者再怎么掩饰也已是显而易见的了。

随着向外太空移民的体制确立，人类的纪元也进入了名叫未来世纪（简称F.C）的新时代，在这个时代中，已将不会再度出现。

这一变动源于进入未来世纪时各国间达成的战争废止协议。该协议决定，掌握地球领导权的国联盟主应当由持有最强技术力和最尖端科研成就的国家来担当，而这一象征国家荣誉与霸权的盟主之位每四年决定一次，上届的冠军国也许将会连任、也许会被更强的国家超越及取代。代替战争决定国际霸权的比赛，便是各国技术结晶的高达——机动斗士（简称MF）间所进行的“高达格斗大会”。

高达格斗是将机体性能与机师武技合为一体进行的比拼，所以与集高精科技于一身的高达一样，各国的代表选手们也都是体能和武技超乎常人的优秀格斗家。每隔四年，便会有这样一群了不起的斗士们带着各自的MF，如陨星般降落到地球上，并在之后的十一个月间以地球为场地互相挑战、厮杀。比赛中只要高达的头部不被破坏，便可以保有参赛资格战斗下去，直到进入第十二个月的决赛。就这样一届一届大会召开又闭幕， 世界的霸主也换了一个又一个，转眼之间，时光已是F.C.60年，第13届高达格斗大会又要开始了……

深蓝色的天幕下，许多球形宇宙货柜带着熊熊烈火，进入地球的大气圈，各国的斗士们正与自己的高达一起置身其中，准备在即将到来的一年间，为了自己与祖国的荣誉而战斗。但在他们中间有一位斗士，怀着与别人完全不同的心情和目的，这位名叫多蒙?卡休的新日本少年，虽然参加比赛并以冠军为目标，但那完全是为了自己的父亲从冰冻刑中被解放出来。