在人体内提供和控制人类能量的线粒体，在二十万年之前，已不甘寄生于人体内，伺机起义革命。二十万年之后的今天，线粒体终于找到机会，它们知道日本国立大学的生化学家永岛利明(三上博史)致力研究单细胞和DNA复制生物的技术，于是安排圣美(叶月里绪菜)与他认识，当圣美嫁了他之后，故意令圣美死于车祸。永岛利明为纪念亡妻，将她的肝细胞抽取出来培育，希望延续她的生命，线粒体由此而得到机会自由繁殖……