双叶幼稚园的老师们带小新他们去坐游船，但是在愉快的吃饭时间，竟然有个穿紧身衣的女生爬上游船。原来她是秘密组织(SML)的成员，SML是个维护世界和平的组织，他们为了要阻止邪恶的组织(猪蹄组)征服世界，于是派她潜入该邪恶组织，偷取执行计划的核心元件。不过，她却在逃亡的途中，无意间上了小新一行人搭乘的游船，使得小新他们也被卷入正邪的对抗战中，并被带往邪恶组织去……