故事讲述的是在２０８６年,地球受邀加入了银河联邦,为了打击外星犯罪者设立了特别机构"银河少女警察".在其任务完结被解散后,却又发生了意外事件,于是银河少女警察们被再度集结,投入了战斗.然而这一切的背后还隐藏着一个巨大的阴谋。