新西元187年，也就是反对联邦政府的蒂帕茵·库尔塞依达斯“DC战争”与异星人的“L5战役”之后半年。地球联邦政府不得不重新组织剩余力量，任命布莱恩·米德克利得为联邦政府大统领，而后通过联邦会议公开了“L5战役”的结果。会上一个被称为“东京宣言”的言论公开承认了地球以外有生命体存在，并威胁到人类的生命。布莱恩·米德克利得希望全世界联合起来，并发表了关于联邦军的架构改编和军备增强的“イージス计划”，在这个计划的名义下大量生产人形兵器，并强化地球防卫能力。为此许多势力如比安博士率领的蒂帕茵·库尔塞依达斯，DC残党等都开始蠢蠢欲动，地球的人类又将陷入一场危机了……