【异形特攻学园】描述距离现今不远的未来世界裡，到处都可以看到异星人，人们一点也不觉得稀奇，即使在小学裡…在小学裡每个人都会被分配到不同的工作，像是生活股长、卫生股长、饲育股长，当然也有叫作「异形应变小组」的工作。

而这次不幸被选为「异形应变小组」的是百合、久美以及小霞三个女生。虽然校内出现异星人这种事大家已习以为常，但是人们对于又湿又黏的 异星人多少还是会感到噁心。大家都不想成为最不受同学欢迎的「异形应变小组」成员，不过同为此小组成员的久美与小霞却是杰出的资优生，而且是自己主动要求出任此一工作。

而她们三人之后又会遇到什麽困难呢？