故事由《海猿》小森阳一原作人气漫画改编，讲述了火爆前拳击手神御藏一号（向井理）和冷静的神枪狙击手苏我伊织（绫野刚）在以保护犯人进行生擒的NPS内合作，发生冲突之余和暴徒进行连场激战。NPS是由警队中唯一可对犯人格杀勿论的组织，包括警视厅特殊部队SAT及警视厅特殊犯搜查系SIT中选取少数精锐成员所组成的组织。

幼年时期的一个假日，与双亲一同外出的神御藏一号突然目睹了父母遭到不明人士开枪射杀，而嫌犯也当场被警察击毙。为了遏止类似惨案不断上演，同时也为了给予嫌犯品嚐同样痛苦的机会，并让受害者家属保有坚强走下去的动力与获知答案的权利，他毅然决定投身警界加入奉行「确保嫌犯主义」的警察厅精英特殊部队「NPS」，以他的双拳打击犯罪。剧场版将以日本东京为故事舞台，描述首都东京遭到毁灭，与国际恐怖活动作战的3个特种部队，将为国家奋战守护未来！