《影鳄第二季》讲述日本各地出现了神秘生物的踪迹，并且这些神秘生物袭击人类。京王理科大学的医学教授番场宗介对此十分感兴趣，于是前往各个神秘生物出现的区域调查真相，随着调查的深入，番场宗介发现这一系列生物袭人事件的背后似乎有更大的阴谋……