故事主要讲述了主人公春日新的日常生活，随着名为“崩坏现象”的奇妙事件的发生，与表妹春日圣一同消失在了异界之中。为了拯救因“崩坏现象”而消失的表妹，新进入了王立比布利亚学园就读。然而意想不到的是，在那里等待他的是巨乳、双马尾、戴眼镜等各具魅力的七名美少女魔道士“TRINITY SEVEN”。就这样，有时严肃的魔法学园爱情喜剧正式拉开帷幕。

剧场版「七人魔法使-悠久图书馆与炼金术少女-」以同名番外篇小说内容为基础，再加上原作者斋藤新创作的情节。主角新和七人魔法使将与剧场版的关键新角色莉莉姆一起迎战强敌。